Самая большая национальность, представленная в Даугавпилсе, — русские, доля которых составляет 46%. Половину населения составляют русские в четырех микрорайонах: в Крыжах (51%), на Химии, в Нидеркунах и Черепово (по 50%). Доля русских выше среднего: от 47% до 48% в восьми микрорайонах и 46% в четырех микрорайонах. В то же время в девяти микрорайонах Даугавпилса удельный вес русских ниже среднего.
Доля второй по численности национальности - латышей - в среднем в Даугавпилсе составляет 21%. Больше всего - 31% - латышей проживают в Лигинишках. В шести микрорайонах латыши составляют от 25% до 29% населения – Средней Полгулянке, Малых Стропах, Центре, Межциемсе, Эспланаде и Дзинтари. Выше среднего доля латышей также в Визбули (22%), Крижах и Крепости (по 23%).
Пропорционально наименьшее количество латышей проживает в Нидеркунах (15%), на Юдовке и Старом Форштадте (по 16%).
Третьей по численности национальностью в Даугавпилсе являются поляки – 13%. В десяти микрорайонах проживает больше поляков, чем в среднем по городу, больше всего в Калкунах и Лигинишках (по 18%). Меньше всего поляков проживает в Крепости (8%) и Крыжах (9%).